Já apresentamos, em comentários anteriores, os vírus bacteriófagos, parte do nosso microbioma. Vários pesquisadores supõem a utilização, no futuro, desses vírus como agentes terapêuticos, devido à sua especificidade para determinados grupos bacterianos.
A possibilidade de identificar os micro-organismos que compõem a microbiota de cada ambiente específico por sequenciamento genético mudou o paradigma sobre a microbiota gástrica.